• Năm 2018: Đào tạo và bồ dưỡng kiến thức về quản lý y tế cho cán bộ lãnh đạo quản lý ngành y tế. Bộ Y tế tổ chức.
• Năm 2010: Bồi dưỡng kiến thức an ninh quốc phòng đối tượng 2 - Quân khu 7.
• Năm 2010: Quản lý bệnh viện - Bộ Y tế.
• Năm 2009: Lý luận chính trị cao cấp - Học viện chính trị hành chính.
• Năm 2002: Lý luận chính trị trung cấp - Trường cán bộ TP.HCM.
• Năm 2007 - 2008: Phẫu thuật Tim mạch tại Đại học Bourgogne, Pháp.
• Năm 2006: Bác sĩ Chuyên khoa cấp 2 tại Đại học Y Dược TP.HCM.
• Năm 1999: Phẫu thuật tim hở tại Đại học Kyoto, Nhật Bản.
• Từ 1996 - 1997: Phẫu thuật Tim mạch tại Trung tâm Y khoa quốc tế của Nhật bản, Tokyo, Nhật Bản.
• Năm 1996: Phó Tiến sĩ khoa học Y Dược hệ chính quy tại Đại học Y Dược TP.HCM.
• Năm 1992: Chuyên khoa cấp I hệ chính quy tại Đại học Y Dược TP.HCM.
• Năm 1988: Tốt nghiệp Bác sĩ Y khoa hệ chính quy tại Đại học Y Dược TP.HCM.

• 2015 – nay: Cán bộ mời giảng của Khoa Y Đại học Quốc gia TP. HCM, Trường Đại học Y khoa Phạm Ngọc Thạch, Trường Đại học Trà Vinh, Học viện Quân Y.
• 1989 – nay: Cán bộ mời giảng của Đại học Y Dược TP. HCM
• 2018 – nay: Phó Giám đốc kiêm Trưởng khoa ngoại Lồng ngực Tim mạch Bệnh viện Thống Nhất.
• 2013 – 2017: Phó Giám đốc kiêm Trưởng khoa ngoại điều trị theo yêu cầu Bệnh viện Thống Nhất.
• 2008 – nay: Phó Giám đốc bệnh viện Thống Nhất.
• 2008 – 2011: Phó Giám đốc kiêm Trưởng phòng kế hoạch tổng hợp.
• 2005 – 2008: Trưởng khoa ngoại điều trị theo yêu cầu Bệnh viện Thống Nhất.
• 2003 – 2005: Phó trưởng khoa ngoại Bệnh viện Thống nhất.
• 1988 – 2003: Khoa phẫu thuật Lồng ngực tim mạch Bệnh viện Chợ Rẫy.

TTƯT.PGS.TS.BS Đỗ Kim Quế giữ những chức vụ sau:

• Phó Giám đốc Bệnh viện Thống Nhất.
• Phẫu thuật tim – Lồng ngực mạch máu.
• Nguyên Trưởng khoa Ngoại – Bệnh viện Thống Nhất.
• Nguyên Bác sĩ Phẫu thuật Lồng ngực – Tim mạch – Bệnh viện Chợ Rẫy.
• Bác sĩ tại khoa Ngoại và Phẫu thuật Lồng ngực – Bệnh viện FV.
• Bác sĩ tại khoa Ngoại tổng hợp – Bệnh viện Đa khoa An Sinh.
• Phó chủ tịch hội Phẫu thuật Lồng ngực – Tim mạch Việt Nam.
• Phó chủ tịch hội Phẫu thuật Lồng ngực – Tim mạch TP.HCM.
• Ủy viên Ban chấp hành hội Ngoại khoa Việt Nam.
• Ủy viên Ban chấp hành hội Phẫu thuật nội soi Việt Nam.
• Ủy viên Ban chấp hành hội Tim mạch TP.HCM.
• Ủy viên Ban chấp hành hội Phẫu thuật Lồng ngực – Tim mạch Châu Á.
• Hội viên hội Ung thư Hoa Kỳ.

Tham gia viết sách:

• Bệnh học Lão khoa. Nhà xuất bản Y học 2012.
• Bệnh học ngoại khoa Lồng ngực tim mạch. Nhà xuất bản Y học 2008.
• Maladie Vasculaire. Paris 2008.

• TTƯT.PGS.TS.BS Đỗ Kim Quế- Phó Giám đốc Bệnh viện Thống Nhất tham gia công tác phòng, chống dịch Covid-19 tại TP.HCM 

• TTƯT.PGS.TS.BS Đỗ Kim Quế - Phó Giám đốc Bệnh viện Thống Nhất đã vinh dự nhận bằng khen của Thủ tướng Chính phủ vì đã có thành tích xuất sắc trong công tác phòng, chống dịch Covid-19 tại TP.HCM